Fue organizado en la primavera de 1961, bajo la dirección de Francisco Maragno y con la participación activa de docentes y músicos como Zoraida Clément, Fernando Castells, Manina Nogueras, Graciela Bianchi, Graciela Roca y Elisa Meyer de Zurbriggen. La finalidad de su creación fue alcanzar niveles técnicos y de adiestramiento adecuados a los requerimientos de un amplísimo y exigente repertorio de música vocal.
Con más de seis décadas de actividad constante, el organismo fue conducido por directores invitados como Olgerts Bistevins, Washington Castro, Eric Simon, José Antonio Gallo, Juan Carlos Zorzi, Jorge Fontenla, Mario Benzecry, Simón Blech, Virtú Maragno, Clydwyn Jones, Jorge Rotter, Guillermo Bonet Müller y Pedro Ignacio Calderón, entre otros. Dio recitales en casi todas las provincias argentinas y en más de 100 localidades de Santa Fe.
Recibió el Segundo Premio en la categoría más importante de Polifonía Contemporánea, en el XVII Concurso Internacional de Coros de Arezzo. Se presentó también en importantes festivales y encuentros internacionales, regionales y provinciales, con gran éxito de público y críticas favorables.
Desde 2023, el Coro Polifónico Provincial es dirigido por la maestra Virginia Bono.
